1、分解作用 土壤里面的各种微生物保持动态平衡，其中有些细菌以其他细菌为食，而有些细菌则以有机质为食。它们相互依赖、相互制约，共同维持着土壤生态系统的稳定与平衡。例如，土壤里面的纤维素分解菌可以把复杂的有机物分解成简单的无机化合物供植物吸收利用；
2、合成作用 一些细菌能够把无法直接被植物吸收利用的矿物质转化成容易吸收的物质形式。如固氮细菌能把大气中的氮气转化为铵离子或硝酸根离子供给植物生长所需，从而提高土壤活性氮含量。部分细菌能合成植物的必需营养物质元素，如铁、锌等微量元素。
3、保护作用 一些细菌能产生抗生菌素，抵抗病原菌的生长；有的细菌能固定土壤里的有害重金属，防止它们向土壤中迁移，避免重金属对土壤、水源以及生物体的危害；有的细菌可以将土壤里某些难以降解的有毒有机物分解为无毒或低毒物质，从而达到保护环境的目的。
4、其他作用 有益细菌还能产生杀菌素，抑制土壤病原菌的繁殖，减少作物病害的发生；可以产生植酸酶，加速土壤中对磷的吸收和运转，有利于作物的生长发育；还可以增加土壤中有机质的含量，为土壤微生物提供丰富的能源，从而促进土壤生态系统功能的发挥。
山依霖优质答主分解死亡的动植物遗体。假如没有细菌，动物尸体和堆满垃圾的街道会有多可怕？事实上，没有细菌，整个环境都无法“再循环”。细菌分解动物和植物遗体时会产生含氮的化合物。植物从土壤吸取这些化合物用作肥料。细菌在植物根部中帮助固定空气中的生命必需的氮。
引起疾病。某些细菌对人或动物是有害的。这些致病菌能生活在生物体内破坏正常的细胞和组织。例如链球菌可通过破坏组织周围的“支架”蛋白并溶解组织来伤害宿主。其他的细菌会产生毒素。肉毒梭菌产生的神经毒素能麻痹呼吸肌并麻痹肌肉导致双眼视力模糊、口眼歪斜。破伤风杆菌的毒素能引起肌肉强直麻痹。链球菌则产生一种“表皮剥脱毒素”能松解表皮造成水疱和剥脱像起火那样引起皮肤组织损毁。
治疗疾病。某些细菌能产生抑制或杀死其他细菌的物质，这种物质就是抗生素。青霉素是从青霉菌中首次提取出的，此后又从其他霉菌和某些细菌发现了许多抗生素。细菌对一些人类疾病具有一定的治疗作用。例如痢疾芽孢杆菌（一种芽孢杆菌），在临床上主要用于治疗痤疮、酒渣鼻以及标疹等皮肤病。
制造食物。许多细菌在食品工业中起很重要的作用。例如酵母和乳酸杆菌使牛奶变酸并产生不同风味的各种奶酪。酵母通过发酵糖产生酒精而制造啤酒和葡萄酒。许多亚洲国家将蔬菜或鱼肉经乳酸菌发酵制成泡菜或鱼酱。
